Servisní laboratoř funkční genomiky a bioinformatiky

 

Místo ÚMG – budova F, místnosti 2.51, 2.64
Tel.: 29644 3148 (laboratoř), 24106 3412 (vedoucí)
Dokumenty Ceník (nový ceník je v prípravě)

 

O pracovišti

V rámci servisní laboratoře zpracováváme vzorky pro funkční genomiku a transkriptomiku, včetně analýz na úrovni jednotlivých buněk, a poskytujeme NGS sekvenační služby. Nabízíme konzultace k projektům a experimentálnímu designu. Provádíme primární bioinformatickou analýzu dat. Služby poskytujeme výzkumným skupinám Ústavu molekulární genetiky, ostatním akademickým institucím i komerčním subjektům.

Servisní laboratoř je vybavena sekvenátorem Illumina NextSeq 500, dvěma systémy pro přípravu knihoven z jednotlivých buněk (10x Genomics Chromium Controller a Bio-Rad ddSEQ), dvěma RT-qPCR cyklery (Roche LC480), dvěma staršími microarray platformami (Affymetrix GeneChip System a Illumina BeadStation 500) a čtečkou EnVision Plate Reader od PerkinElmer. Laboratoř dále provozuje přístroje pro analýzu kvality a kvantity analyzovaných vzorků (spektrofotometr Nanodrop, fluorimetr Qubit, kapilární elektroforézy Agilent Bioanalyzer 2100 a Agilent Fragment Analyzer 5200). Jako sdílené vybavení jsou k dispozici dva ultrazvukové sonikátory (Covaris ME 220 a Bioruptor).

Servisní laboratoř je součástí Oddělení genomiky a bioinformatiky.

Pracovníci

Vedoucí Ing. Hynek Strnad, Ph.D.
Zástupce vedoucího Mgr. Michal Kolář, Ph.D.
Odborní pracovníci Ing. Miluše Hradilová (Hroudová), Ph.D. (částečný úvazek)
Ing. Martina Chmelíková (mateřská dovolená)
Mgr. Šárka Kocourková
Mgr. Marcela Vedralová (mateřská dovolená)

 

Galerie

Poslední změna: 11. srpen 2020