Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
| Místo | IMG – budova F, místnosti 2.51, 2.64 |
| Kontakt | Tel.: 29644 3148 (laboratoř), 24106 3412 (vedoucí) |
| Dokumenty | Ceník Poptávkový formulář |
V rámci servisní laboratoře zpracováváme vzorky pro analýzy funkční genomiky a transkriptomiky, včetně prostorové transkriptomiky a analýz na úrovni jednotlivých buněk. Poskytujeme také služby sekvenování nové generace (NGS). Nabízíme odborné konzultace při přípravě projektů a návrhu experimentálního designu a provádíme primární bioinformatickou analýzu získaných dat. Naše služby jsou určeny výzkumným skupinám Ústavu molekulární genetiky, dalším akademickým institucím i komerčním subjektům.
Servisní laboratoř je vybavena moderními technologiemi pro genomické analýzy, včetně sekvenátorů Illumina NextSeq 2000 a Oxford Nanopore MinION Mk1B a PromethION 2 Solo. Pro přípravu knihoven z jednotlivých buněk je k dispozici systém 10x Genomics Chromium X. Pro analýzu prostorové genové exprese využíváme technologii Visium od společnosti 10x Genomics ve spojení se systémem CytAssist. Laboratoř je rovněž vybavena platformou Xenium pro in situ analýzu, která integruje zobrazování ve vysokém rozlišení, dekódování signálu a následnou analýzu dat. Technologie Xenium In Situ umožňuje vysokokapacitní subcelulární mapování stovek RNA cílů a poskytuje tak nové poznatky o buněčné struktuře a funkci.
Laboratoř dále disponuje kryostatem Leica CM1950, fluorescenčním mikroskopem Leica DMi8, dvěma RT-qPCR cyklery (Roche LightCycler 480), jedním CFX Opus Real-Time PCR cyklerem a systémem pro droplet digital PCR (Bio-Rad QX200) a multimodální čtečkou mikrodestiček EnVision Plate Reader (PerkinElmer). Pro automatizované dávkování kapalin je k dispozici stolní dispenzor Mantis (Formulatrix).
Součástí vybavení jsou také přístroje pro stanovení kvality a kvantity analyzovaných vzorků, včetně spektrofotometru NanoDrop, fluorimetru Qubit a systémů kapilární elektroforézy Agilent Bioanalyzer 2100 a Agilent Fragment Analyzer 5200. V rámci sdílené infrastruktury jsou dostupné také dva ultrazvukové sonikátory (Covaris ME220 a Bioruptor).
Servisní laboratoř je součástí Laboratoře genomiky a bioinformatiky.
