Servisní laboratoř funkční genomiky a bioinformatiky

Michal Kolář

Vedoucí pracoviště

Michal Kolář
MístoIMG – budova F, místnosti 2.51, 2.64
KontaktTel.: 29644 3148 (laboratoř), 24106 3412 (vedoucí)
DokumentyCeník se připravujeCeník
Poptávkový formulář

O pracovišti

V rámci servisní laboratoře zpracováváme vzorky pro funkční genomiku a transkriptomiku, včetně analýz na úrovni jednotlivých buněk, a poskytujeme NGS sekvenační služby. Nabízíme konzultace k projektům a experimentálnímu designu. Provádíme primární bioinformatickou analýzu dat. Služby poskytujeme výzkumným skupinám Ústavu molekulární genetiky, ostatním akademickým institucím i komerčním subjektům.

Servisní laboratoř je vybavena sekvenátory Illumina NextSeq 500 a Oxford Nanopore Minion Mk1b, dvěma systémy pro přípravu knihoven z jednotlivých buněk (10x Genomics Chromium Controller a Bio-Rad ddSEQ), dvěma RT-qPCR cyklery (Roche LC480), droplet digital PCR systémem (Bio-Rad QX200), dvěma staršími microarray platformami (Affymetrix GeneChip System a Illumina BeadStation 500) a čtečkou EnVision Plate Reader od PerkinElmer. Laboratoř dále provozuje přístroje pro analýzu kvality a kvantity analyzovaných vzorků (spektrofotometr Nanodrop, fluorimetr Qubit, kapilární elektroforézy Agilent Bioanalyzer 2100 a Agilent Fragment Analyzer 5200). Jako sdílené vybavení jsou k dispozici dva ultrazvukové sonikátory (Covaris ME 220 a Bioruptor).

Servisní laboratoř je součástí Laboratoře genomiky a bioinformatiky.

Pro rezervace přístrojového vybaveni, prosím, používejte rezervační systém Calpendo.

Galerie

Pravidla pro přístup do laboratoře

Přístup pro interní uživatele
Přístup pro externí uživatele

Další informace o skupině