Místo | IMG – budova F, místnosti 2.51, 2.64 |
Kontakt | Tel.: 29644 3148 (laboratoř), 24106 3412 (vedoucí) |
Dokumenty | Ceník se připravujeCeník Poptávkový formulář |
V rámci servisní laboratoře zpracováváme vzorky pro funkční genomiku a transkriptomiku, včetně analýz na úrovni jednotlivých buněk, a poskytujeme NGS sekvenační služby. Nabízíme konzultace k projektům a experimentálnímu designu. Provádíme primární bioinformatickou analýzu dat. Služby poskytujeme výzkumným skupinám Ústavu molekulární genetiky, ostatním akademickým institucím i komerčním subjektům.
Servisní laboratoř je vybavena sekvenátory Illumina NextSeq 500 a Oxford Nanopore Minion Mk1b, dvěma systémy pro přípravu knihoven z jednotlivých buněk (10x Genomics Chromium Controller a Bio-Rad ddSEQ), dvěma RT-qPCR cyklery (Roche LC480), droplet digital PCR systémem (Bio-Rad QX200), dvěma staršími microarray platformami (Affymetrix GeneChip System a Illumina BeadStation 500) a čtečkou EnVision Plate Reader od PerkinElmer. Laboratoř dále provozuje přístroje pro analýzu kvality a kvantity analyzovaných vzorků (spektrofotometr Nanodrop, fluorimetr Qubit, kapilární elektroforézy Agilent Bioanalyzer 2100 a Agilent Fragment Analyzer 5200). Jako sdílené vybavení jsou k dispozici dva ultrazvukové sonikátory (Covaris ME 220 a Bioruptor).
Servisní laboratoř je součástí Laboratoře genomiky a bioinformatiky.
Pro rezervace přístrojového vybaveni, prosím, používejte rezervační systém Calpendo.
Interním uživatelem servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky je každý uživatel přístrojového vybavení laboratoří, který je zaměstnancem IMG.
Pro využívání služeb servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky musí mít interní uživatel založen uživatelský účet v systému pro správu identit uživatelů v síti img.cas.cz s oprávněním pro přihlašování na počítače v servisních laboratořích.
Registrační procedura
Přihlašte se do rezervačního systému Calpendo na IMG. Pokud chcete využívat služby servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky (FGB), zaregistrujte se do facility dle instrukcí na stránce Register facility.
Externím uživatelem servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky je každý uživatel přístrojového vybavení laboratoří, který není zaměstnancem IMG.
Pro využívání služeb servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky musí mít externí uživatel založen uživatelský účet v systému pro správu identit uživatelů v síti img.cas.cz s oprávněním pro přihlašování na počítače v servisních laboratořích.
Pracovníci servisní laboratoře mohou kdykoliv požádat o zrušení přístupu externího uživatele.
Registrační procedura
Prosím neregistrujte se, pokud jste již uživatelem rezervačního systému Calpendo na IMG. Pokud chcete využívat služby servisní laboratoře funkční genomiky a bioinformatiky (FGB), zaregistrujte se do facility dle instrukcí na stránce Register facility.
Prosím zaregistrujte se, pokud ještě nejste uživatelem rezervačního systému Calpendo na IMG.