Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Naše výzkumná skupina se zabývá regulací udržování a osudu hematopoetických kmenových buněk (HSC) transkripčními faktory a jejich cílovými geny. Zjišťujeme, zda jsou tyto prvky u lidských leukémií změněny (zejména u akutní myeloidní leukémie, AML), a objasňujeme jejich podíl na leukemogenezi. Dále zkoumáme, jak vnější faktory regulují sebeobnovu HSC a jak ovlivňují jejich diferenciaci na myeloidní buněčné linie. Tři hlavní směry našeho výzkumu jsou:
K dosažení těchto cílů používáme myší a lidské primární buňky a také myší modely. Provádíme řadu in vitro testů k hodnocení buněčné proliferace, apoptózy, potenciálu tvorby kolonií, schopnosti opětovného množení, diferenciace a migrace. Dále provádíme testy transplantace buněk myší kostní dřeně, vystavujeme myši infekčním agens a provádíme testy mobilizace HSC in vivo. Pomocí primárních buněk pacientů trpících AML vytváříme modely PDX. Abychom získali nové poznatky o molekulárním mechanismu regulace a transformace kmenových buněk, využíváme přístupy molekulární biologie včetně RNA-seq, ATAC-seq a ChIP-seq/qPCR.
Společně se snažíme pochopit mechanismy řídící udržování a osud HSC a určit vnitřní a vnější faktory, jež přispívají k rozvoji leukémie. V konečném důsledku naše práce přispěje k získání poznatků pro vývoj lepších terapií AML.
